Akuntansi manajemen dapat menjadi alat yang efektif untuk perencanaan bisnis, pengembangan strategis dan pemantauan internal. Pada saat yang sama, ada masalah potensial yang dapat timbul dengan hanya mengandalkan informasi akuntansi manajemen. Mengandalkan akuntansi manajemen saja bisa berbahaya dan mengarahkan bisnis ke arah yang salah. Manajer perlu menyadari kelemahan akuntansi manajemen sehingga mereka dapat mengevaluasi informasi yang diberikan secara kritis. Manajer yang dapat melakukan ini akan dapat menggunakan informasi akuntansi manajemen bersamaan dengan informasi lain untuk membuat keputusan bisnis yang terinformasi.
Kurangnya Standardisasi
Akuntansi keuangan sangat terstandarisasi, dengan akuntan keuangan menggunakan pedoman seperti Prinsip Akuntansi yang Diterima Secara Umum (GAAP). Berbeda sekali dengan ini, akuntansi manajemen tidak memiliki seperangkat prosedur standar. Seorang akuntan manajemen dapat menyusun sistem dan metriknya sendiri untuk mengevaluasi keuangan organisasi. Kerugian dari ini adalah bahwa metode satu akuntan dapat sangat bervariasi dari metode yang lain. Ini dapat menghasilkan inkonsistensi dalam cara tolok ukur dan evaluasi keuangan diukur. Hal ini juga mengharuskan akuntan untuk menjadi lebih berpengetahuan dan mampu menafsirkan sistem akuntansi yang dikembangkan oleh orang lain.
Penekanan berlebihan pada Informasi Kuantitatif
Data kuantitatif dapat berharga dalam membuat keputusan bisnis yang terinformasi. Akuntansi manajemen, bagaimanapun, berfokus secara eksklusif pada ukuran kuantitatif dan mengabaikan faktor-faktor yang tidak dapat diukur dalam dolar dan sen. Misalnya, mungkin tampak masuk akal secara finansial untuk memindahkan fasilitas produksi ke suatu daerah dengan biaya upah yang lebih rendah. Akuntansi manajemen dapat menghitung penghematan upah dan kenaikan tertentu dalam biaya yang mungkin terjadi (misalnya, biaya pengiriman atau bea impor). Akuntansi manajemen tidak dapat, bagaimanapun, faktor dalam hal-hal seperti tabungan terkait dengan niat baik anggota masyarakat di wilayah tersebut, atau masalah hubungan masyarakat yang dapat timbul dari keputusan seperti itu. Akuntansi manajemen sangat rasional, tetapi terkadang menjadi sepenuhnya rasional dapat menjadi kerugian.
Subyektivitas
Akuntansi manajemen memungkinkan banyak subjektivitas ketika membuat metrik dan metode untuk mengukur kinerja. Ini bermasalah karena keyakinan dan bias pribadi akuntan dapat berdampak pada cara kinerja diukur. Misalnya, jika akun manajemen diperlukan untuk mengukur produktivitas pekerja, ia dapat fokus secara eksklusif pada output dan tidak memperhitungkan input pekerja yang dapat memiliki efek mendalam pada produktivitas keseluruhan. Ini memengaruhi perusahaan dan karyawan. Perusahaan terpengaruh karena informasi yang digunakannya mungkin bukan yang terbaik dan karyawan dapat terpengaruh jika mereka merasa tidak dievaluasi secara adil.