Struktur organisasi menentukan bagaimana karyawan dan manajemen berkomunikasi dalam suatu agensi. Seperti halnya bisnis di sektor swasta menggunakan struktur organisasi mereka untuk mencapai tujuan produktivitas dan profitabilitas, agensi di sektor publik menggunakan struktur organisasi untuk menyelesaikan tugas mereka demi kebaikan semua warga negara. Lembaga sektor publik mengandalkan definisi peran yang ketat dalam struktur organisasi untuk melaksanakan misi mereka.
Struktur Vertikal
Mayoritas lembaga pemerintah di setiap tingkatan menggunakan struktur vertikal.Struktur organisasi vertikal didefinisikan dengan memiliki direktur atau kepala departemen di bagian atas, dengan sejumlah manajer menengah dan posisi lebih rendah lagi. Kepala departemen mendikte prosedur operasional, manajer menengah membuat rencana untuk menerapkan prosedur tersebut, dan pekerja tingkat bawah melaksanakan tugas yang diperlukan. Sementara berbagai cabang dinas militer berdiri sebagai contoh utama dari struktur vertikal, banyak lembaga sipil juga menggunakan metode ini.
Struktur Horisontal
Sementara struktur vertikal berfokus pada hierarki, struktur horizontal menggunakan pengaturan yang lebih setara. Struktur horizontal menggunakan lebih sedikit lapisan antara manajemen dan tenaga kerja dan memungkinkan komunikasi yang lebih terbuka antara lapisan-lapisan itu. Meskipun jarang terlihat di tingkat pemerintahan tertinggi, struktur horizontal sering digunakan di lembaga-lembaga dengan yurisdiksi yang lebih kecil, anggaran yang lebih rendah dan lebih sedikit pegawai. Misalnya, direktur departemen kesehatan setempat dapat menggunakan struktur horizontal untuk berkomunikasi langsung dengan inspektur dan karyawan lain daripada menggunakan manajer menengah.
Struktur Divisi
Struktur divisi memisahkan karyawan berdasarkan spesialisasi pekerjaan atau geografi. Setiap departemen mengawasi operasinya sendiri dengan input minimal dari departemen lain. Misalnya, di tingkat federal, Departemen Luar Negeri menangani urusan luar negeri. Dalam Departemen Luar Negeri adalah divisi yang menangani urusan yang terkait dengan pertumbuhan ekonomi, urusan politik, kontrol senjata dan hak asasi manusia.
Struktur matriks
Struktur organisasi matriks menggunakan sistem di mana hubungan antara karyawan dan manajemen ditetapkan sebagai kisi - atau matriks - alih-alih dalam hierarki konvensional. Struktur matriks memungkinkan lembaga dengan tugas yang tumpang tindih untuk berkomunikasi satu sama lain, tetapi juga dapat menyebabkan duplikasi upaya. Sebagai contoh, Direktorat Sains dan Teknologi, sebuah divisi dari Departemen Keamanan Dalam Negeri, menggunakan struktur matriks untuk mengoordinasikan upaya anti-terorisme.